Enter the sequence


Example input
More Parameters

Example for substitution:

CGCCGCCGCCTCTACTGGGGCTTCTTCTCGGGCCGCGGCCGCGTCAAGCCGGGGGGGCGCTGGCGCGA(/T)GGCCGCCTGGCAACTCTGCGACTACTACCTGCC

Example for insertion:

CGCCGCCGCCTCTACTGGGGCTTCTTCTCGGGCCGCGGCCGCGTCAAGCCGGGGGGGCGCTG(+ATT)GCGCGAGGCCGCCTGGCAACTCTGCGACTACTACCTGCC

Example for deletion:

CGCCGCCGCCTCTACTGGGGCTTCTTCTCGGGCCGCGGCCGCGTCAAGCCGGGGGGGC(-GCTGGCGCGA)GGCCGCCTGGCAACTCTGCGACTACTACCTGCC

Above three examples above represent the input formats of three different editing types.

  • The bases to be edited are marked with a pair of parentheses "()".

  • Substitution is indicated by backslash "/", and the example is used to replace A by T.

  • Insertion is indicated by plus sign "+", and the example indicates that ATT will be inserted at the parenthesis position

  • Deletion is indicated by minus sign "-", and the example indicates that GCTGGCGCGA will be deleted at the parenthesis position.

    • PAM Maximum Edit-to-Nick Distance
    Maximum PBS Length Maximum RTT Length
    Minimum PBS Length Minimum RTT Length
    Number of Optimized pegRNAs Assembly
    Minimum Nick-to-Nick Distance Maximum Nick-to-Nick Distance
    Minimum Downstream Homology

    Use an example: Substitution Insertion Deletion
    Example for FASTA file History
    UID Input sequence PAM CUT SIZE MIN PBS MAX PBS MIN RT MAX RT MIN DIS SGRNA MAX DIS SGRNA HOMOLOGY Number show
    260812213807_j0bi CGCCGCCGCCTCTACTGGGGCTTCTTCTCGGGCCGCGGCCGCGTCAAGCCGGGGGGGCGCTGGCGCGA(/T)GGCCGCCTGGCAACTCTGCGACTACTACCTGCC NGG 10 8 17 8 24 0 100 5 10
    260811165658_qxd1 aaagtccacattgattatttgcacggcgtcacactttgctatgccatagcatttttatccataagattagcggatcctacctgacgctttttatcgcaactctctactgtttctccatacccgtttttttgggctagcgattgaaaacgatgagccataT(+actgccaggagt)tctaggccgcgattaaattccaacatggatgctgatttatatgggtataaatgggctcgcgataatgtcgggcaatcaggtgcgacaatctatcgattgtatgggaagcccgatgcgccagagttgtttctgaaacatggcaaaggtagcgttgccaatg NGG 10 8 17 8 24 0 100 5 10
    260811165525_6zqs ttatcgcaactctctactgtttctccatacccgtttttttgggctagcgattgaaaacgatgagccatat(+actcgactaggacag)ctaggccgcgattaaattccaacatggatgctgatttatatgggtataaatgggctcgcgataatgtcgggcaatcaggtgcgacaatctatcgattgtatgggaagcccgatgcgccagagttgtttctgaaacatggcaaaggtagcgttgccaatga NGG 10 8 17 8 100 0 100 5 10
    260811165444_8pvc gccatagcatttttatccataagattagcggatcctacctgacgctttttatcgcaactctctactgtttctccatacccgtttttttgggctagcgattgaaaacgatgagccatat(+atcggac)ctaggccgcgattaaattccaacatggatgctgatttatatgggtataaatgggctcgcgataatgtcgggcaatcaggtgcgacaatctatcgattgtatgggaagcccgatgcgccagagttgtttctgaaacatggcaaaggtagcgttgccaatga NGG 10 8 17 8 24 0 100 5 10
    260806181727_4aov GATACACGTCTGCAGTCAACTGGAATTTTCATGATTGAATTTTGTAAGGTATTTTGAAATAATTTTTCATATAAAGGTGAGTTTGTATTAAAAGGTACTGGTGGAGTATTTGATAGTGTATTAACCTTATGTGTGACATGTTCTAATATAGTCACATTTTCATTATTTTTATTATAAGGCCTGCTGAAAATGACTGAATATAAACTTGTGGTAGTTGGAGCTG(/A)TGGCGTAGGCAAGAGTGCCTTGACGATACAGCTAATTCAGAATCATTTTGTGGACGAATATGATCCAACAATAGAG NGG 10 8 17 8 24 0 100 5 10
    260806181035_57s4 GATACACGTCTGCAGTCAACTGGAATTTTCATGATTGAATTTTGTAAGGTATTTTGAAATAATTTTTCATATAAAGGTGAGTTTGTATTAAAAGGTACTGGTGGAGTATTTGATAGTGTATTAACCTTATGTGTGACATGTTCTAATATAGTCACATTTTCATTATTTTTATTATAAGGCCTGCTGAAAATGACTGAATATAAACTTGTGGTAGTTGGAGCTG(/A)TGGCGTAGGCAAGAGTGCCTTGACGATACAGCTAATTCAGAATCATTTTGTGGACGAATATGATCCAACAATAGAG NGG 10 8 17 8 24 0 100 5 10
    260727120824_5yl7 CGCCGCCGCCTCTACTGGGGCTTCTTCTCGGGCCGCGGCCGCGTCAAGCCGGGGGGGCGCTG(+ATT)GCGCGAGGCCGCCTGGCAACTCTGCGACTACTACCTGCC NGG 10 8 17 8 24 0 100 5 10
    260722235809_iqlr ATGGGCTCACCGCTGAGGTTCGACGGGCGGGTGGTACTGGTCACCGGCGCGGGGGCAGGATTGGGCCGAGCCTATGCCCTGGCTTTTGCAGAAAGAGGAGCGTTAGTTGTTGTGAATGATTTGGGAGGGGACTTCAAAGGAGTTGGTAAAGGCTCCTTAGCTGCTGATAAGGTTGTTGAAGAAATAAGAAGGAGAGGTGGAAAAGCAGTGGCCAACTATGATTCAGTGGAAGAAGGAGAGAAGGTTGTGAAGACAGCCCTGGATGCTTTTGGAAGAATAGATGTTGTGGTCAACAATGCTGGAATTCTGAGGGATCGTTCCTTTGCTAGGATAAGTGATGAAGACTGGGATATAATCCACAGAGTTCATTTGCGGGGTTCATTCCAAGTGACACGGGCAGCATGGGAACACATGAAGAAACAGAAGTATGGAAGGATTATTATGACTTCATCAGCTTCAGGAATATATGGCAACTTTGGCCAGGCCAATTATAGTGCTGCAAAGTTGGGTCTTCTGGGCCTTGCAAATTCTCTTGCAATTGAAGGCAGGAAAAGCAACATTCATTGTAACACCATTGCTCCTAATGCGGGATCACGGATGACTCAGACAGTTATGCCTGAAGATCTTGTGGAAGCCCTGAAGCCAGAGTATGTGGCACCTCTTGTCCTTTGGCTTTGTCACGAGAGTTGTGAGGAGAATGGTGGCTTGTTTGAGGTTGGAGCAGGATGGATTGGAAAATTACGCTGGGAGCGGACTCTTGGAGCTATTGTAAGACAAAAGAATCACCCAATGACTCCTGAGGCAGTCAAGGCTAACTGGAAGAAGATCTGTGACTTTGAGAATGCCAGCAAGCCTCAGAGTATCCAAGAATCAACTGGCAGTATAATTGAAGTTCTGAGTAAAATAGATTCAGAAGGAGGAGTTTCAGCAAATCATACTAGTCGTGCAACGTCTACAGCAACATCAGGATTTGCTGGAGCTATTGGCCAGAAACTCCCTCCATTTTCTTATGCTTATACGGAACTGGAAGCTATTATGTATGCCCTTGGAGTGGGAGCGTCAATCAAGGATCCAAAAGATTTGAAATTTATTTATGAAGGAAGTTCTGATTTCTCCTGTTTGCCCACCTTCGGAGTTATCATAGGTCAGAAATCTATGATGGGTGGAGGATTAGCAGAAATTCCTGGACTTTCAATCAACTTTGCAAAGgtatgcctaataaaaaacctttattttgcttttctatttctgtaaatattattcattaatgtcatatcttatatatatgtgtgtgtagtgtgtgtatatatatttatataattatttatagtggttagtttagcatatcttttgatttttctttttaagaataaaagaggggagagttagttcaaaatgccagcaaaaagaagaaaataacaagtatgtgtagtcccataaccctggcataatgttattctctctctgccatttacttgattcttgaccaagggtaaataacatctctaggcttcagtttccttatctataaaatggatatgataatcctcacctcatgacattggtgaagaagcaagccagggaggagtatttaaagcaaatagcacatacttgacttgtttttggaacagtaatagggccagcatagctgtagagtgagcaagggggcaatggtaggagaaggtcatggagtaattgtaaagatttcagcatatactttgatgaacatgtgaagccatttgttgatctgagctgagtagtgacatgatctggctatgttcacagactggtacaagcttgttgcttttggagactaggttataagggagtcaagcatgaaagcagagaaaccacttaagagtctattatagtaatccaagtaaaagtgctgcatatgagggttagaaaagaggagtcaaggatgaagatgtttgttctggataattgggatatgtatatatatatagagagagagatgggtgcatatatatacattgtatatagttatacattgtatatagttatacattacacatatctatatgtaatgtataattatgtatagtgtatttaatatgtatagtaattacatatggcattatgtataatttatacatacacatttattttaaggtggggttgatcaggagttggttttaaatatgtttgaggtgtctgttacacatttaagtggaaatataagatggacagttgaatatatgagtctagagttcagggaggggtctaactgggtccttagcatttacgtgatgtttaaatactggagattagatgaagtcacctaatgtgtgagagtaagtagagaagaggcctgagtttagaggccctgaaatgttgagagggtaaagagatacagaggaactagcaaaaagagactgcacaggaatggttggtgaggtatgaggagtatcatgagaatagggtatttgagaagccaaatgaatgaagtgtgtcaagaaggaggagggaacagtggtgagaagttctttgagacagggtatattttatttcttggagtaagattcaggttatgagcctggtaataatttttgaatcatggggctatgagctggtatctgtaactttgactgattggagaacttatttactggtggatcagttagcccattgctgctctgagttgatggccacttattttattagagtgtttcatgaagttgggaggaagacaagaaatatgtgctgggcagtttgctgtttcattcacactcccatggttagttactatatactctgaacaatgtaaatgcaaaaaattaaaacaaatgtttcaaaattccccctaacaattggaaatcgtaaatggtgttcatgcatcttggaacttgaatcctagtcttcttaaccttgactttttcaagccgtatgacacagtaaagctgaccttcatttgtcttctcatcaaccacctccccttcttcttcttcctttttttttttttttaaaatccttttgggttctgaggaagactggtaaactggccctctgcagtgaaagtgggatcatttgagtgtatgcttcaagttttggttttcctgtcctgttgttttcctatataccttggtgcattctttgtttgatacattgaggttaagtggctattaagttacacagtgtccttagtatctactctttgtagataatttacaaagtattataagaaagggatattcacattgacagtgctttcattttgaacatggttgtaaggtttttctttgtgttttagttgtgtcgtttgtatttggtatatgtgacctgaaattactagcactggcgcatttgttcattcttattcaatgaatatttattggatgcccaatatgttccaggcactgttataagttctgggaatacagcctagtttattgtctcttggcaaataatatgtaattaacagtcaacaaggctttatgaacgccaagaaagaacacaaatatatcttctctgctccagaagagctgactgtcttgagattgggggattgattatttttcaatcacatgattaagaagaagccaaacagagatagataacttggagagaaatgtgagcctgtggatggtaaaatgtcacttgcgagtaacagtatccataggcagaacctgtggagcaagaaagtttgctaataaaattttgtttaccctaacatagGTTCTTCATaGAGAGCAGTACTTAGAGTTATATAAACCACTTCCCAGAGCAGgtgagttattgatatactaattccataataccatacttttatttccagattaaccttttaaacaacatcagtgtgttaaactggtatagagtgacctaatgaaacatatcacaaattgttatgcacatgtgagccattagagtagactgatgttaactagtatctgttttggtcaccttaagctttgtcctttaatagtcttaaaaatttatttcataatttatctctgttgatgtatgtgttattaacaactgaaaggaacgttcgtgtatgtgctctagacttagtgattgcatataatctgttatggttcttatgattattgttcttttctcaggtatttatctttatactgattttcataaagcaaacaatgttaaaagatacagaatttcttgtaattcatttttttctttttttttggagaaaataaaaacaagtctttaataatcatttttacttttctcaaaaatatcttacttgtttagtaaatctcttttaatttttttcactataattggatatatttatttctctactttgatgtttgaatgttgtctaattatatactggtcatataaggtggtagaatacaaaaaggaatgttttgttaatatttgtcatttcatgttatacaatgtagaggtcggcaagtagctagaatcctacttgaatatttttcttaaacctttttatttttctaaaaaatgtatgagatttttattgcttgaagctgaatagctttatttcagtgtaagtattatagcataaggtttcaaaacagctctttttatgtgaaacagtacactttgtggtgattgtgcattgatcaaatatctgctggatacccagtatttgcaaggcacagtattaggtagtaggtaattttctaacctgtctgtatatcaaaatcacccgagttattacattatattatctgttaatttaagtaaaatgtagattctcaatcccaaccttggaaattgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtatgtgtgcatgtatgtatgtggtggggtggtggtgttggtgacagtggctaggaagctccttacatgtttcatatgtacccagccctatgggtccacttggaaaccattgttataagggaagtagaaatgtgcaagataggtttctgccgttagggattttaaaatacgaaaagagagattagatgtatactccagagtgatgataactgaacagtgatgtgaatagga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